Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF9Q00978 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms