Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDC42EP1Q00587 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP1Q00587 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.8 ms