Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK6Q00534 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK6Q00534 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms