Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP2R2BQ00005 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP2R2BQ00005 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms