Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD3P84022 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD3P84022 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD3P84022 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms