Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIM1P81133 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIM1P81133 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIM1P81133 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIM1P81133 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIM1P81133 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIM1P81133 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIM1P81133 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIM1P81133 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIM1P81133 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIM1P81133 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIM1P81133 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SIM1P81133 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIM1P81133 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIM1P81133 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIM1P81133 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIM1P81133 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIM1P81133 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIM1P81133 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIM1P81133 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIM1P81133 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIM1P81133 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIM1P81133 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIM1P81133 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIM1P81133 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIM1P81133 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SIM1P81133 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIM1P81133 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIM1P81133 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIM1P81133 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIM1P81133 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIM1P81133 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIM1P81133 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIM1P81133 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIM1P81133 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIM1P81133 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIM1P81133 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIM1P81133 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIM1P81133 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIM1P81133 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIM1P81133 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIM1P81133 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIM1P81133 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIM1P81133 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIM1P81133 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SIM1P81133 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIM1P81133 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIM1P81133 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIM1P81133 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIM1P81133 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIM1P81133 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIM1P81133 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIM1P81133 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIM1P81133 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIM1P81133 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIM1P81133 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIM1P81133 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIM1P81133 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIM1P81133 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIM1P81133 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIM1P81133 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIM1P81133 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIM1P81133 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIM1P81133 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIM1P81133 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIM1P81133 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIM1P81133 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIM1P81133 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIM1P81133 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIM1P81133 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIM1P81133 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIM1P81133 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIM1P81133 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIM1P81133 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIM1P81133 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIM1P81133 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIM1P81133 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIM1P81133 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIM1P81133 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIM1P81133 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIM1P81133 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIM1P81133 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIM1P81133 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIM1P81133 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIM1P81133 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIM1P81133 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIM1P81133 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIM1P81133 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIM1P81133 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIM1P81133 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIM1P81133 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIM1P81133 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIM1P81133 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIM1P81133 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIM1P81133 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIM1P81133 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIM1P81133 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIM1P81133 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIM1P81133 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIM1P81133 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms