Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEP78395 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEP78395 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms