Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC5P78333 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC5P78333 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC5P78333 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC5P78333 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC5P78333 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC5P78333 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC5P78333 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC5P78333 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC5P78333 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC5P78333 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC5P78333 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC5P78333 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC5P78333 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC5P78333 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC5P78333 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC5P78333 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC5P78333 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC5P78333 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC5P78333 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC5P78333 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC5P78333 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC5P78333 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC5P78333 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC5P78333 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC5P78333 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC5P78333 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC5P78333 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC5P78333 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC5P78333 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC5P78333 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC5P78333 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC5P78333 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC5P78333 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC5P78333 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC5P78333 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC5P78333 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC5P78333 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC5P78333 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC5P78333 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC5P78333 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC5P78333 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC5P78333 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC5P78333 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC5P78333 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC5P78333 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC5P78333 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC5P78333 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC5P78333 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPC5P78333 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPC5P78333 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPC5P78333 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPC5P78333 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPC5P78333 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC5P78333 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC5P78333 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC5P78333 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC5P78333 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC5P78333 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC5P78333 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC5P78333 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC5P78333 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC5P78333 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC5P78333 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC5P78333 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC5P78333 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC5P78333 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC5P78333 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC5P78333 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC5P78333 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC5P78333 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC5P78333 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC5P78333 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC5P78333 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC5P78333 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC5P78333 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC5P78333 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC5P78333 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC5P78333 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC5P78333 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC5P78333 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC5P78333 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC5P78333 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC5P78333 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC5P78333 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC5P78333 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC5P78333 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC5P78333 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC5P78333 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC5P78333 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC5P78333 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC5P78333 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC5P78333 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC5P78333 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC5P78333 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC5P78333 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC5P78333 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC5P78333 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC5P78333 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC5P78333 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms