Protein–RNA interactions for Protein: P78330

PSPH, Phosphoserine phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP78330 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSPHP78330 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSPHP78330 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSPHP78330 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSPHP78330 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSPHP78330 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSPHP78330 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSPHP78330 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSPHP78330 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSPHP78330 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSPHP78330 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSPHP78330 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSPHP78330 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSPHP78330 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSPHP78330 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSPHP78330 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSPHP78330 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSPHP78330 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSPHP78330 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSPHP78330 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSPHP78330 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSPHP78330 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSPHP78330 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSPHP78330 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSPHP78330 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSPHP78330 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSPHP78330 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPHP78330 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPHP78330 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPHP78330 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPHP78330 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPHP78330 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPHP78330 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPHP78330 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPHP78330 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPHP78330 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPHP78330 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPHP78330 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPHP78330 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPHP78330 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPHP78330 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPHP78330 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPHP78330 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPHP78330 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPHP78330 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPHP78330 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPHP78330 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPHP78330 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPHP78330 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPHP78330 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPHP78330 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPHP78330 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPHP78330 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPHP78330 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPHP78330 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPHP78330 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPHP78330 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPHP78330 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPHP78330 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPHP78330 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPHP78330 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPHP78330 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPHP78330 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPHP78330 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPHP78330 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPHP78330 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPHP78330 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPHP78330 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPHP78330 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPHP78330 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPHP78330 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPHP78330 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPHP78330 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPHP78330 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPHP78330 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPHP78330 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPHP78330 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPHP78330 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPHP78330 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPHP78330 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPHP78330 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPHP78330 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPHP78330 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPHP78330 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPHP78330 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPHP78330 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPHP78330 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPHP78330 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPHP78330 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPHP78330 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPHP78330 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPHP78330 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPHP78330 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPHP78330 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPHP78330 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPHP78330 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPHP78330 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPHP78330 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPHP78330 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPHP78330 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms