Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNC1P63316 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms