Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD3P62318 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNRPD3P62318 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms