Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAP25P60880 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP25P60880 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP25P60880 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP25P60880 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP25P60880 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP25P60880 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP25P60880 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP25P60880 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP25P60880 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP25P60880 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP25P60880 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP25P60880 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP25P60880 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP25P60880 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP25P60880 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP25P60880 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP25P60880 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP25P60880 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP25P60880 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP25P60880 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP25P60880 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SNAP25P60880 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP25P60880 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP25P60880 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP25P60880 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP25P60880 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP25P60880 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP25P60880 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP25P60880 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SNAP25P60880 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SNAP25P60880 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SNAP25P60880 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SNAP25P60880 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms