Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFC1-1P60608 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms