Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVFC1P60507 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVFC1P60507 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms