Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTENP60484 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTENP60484 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTENP60484 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTENP60484 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTENP60484 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTENP60484 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTENP60484 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTENP60484 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTENP60484 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTENP60484 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTENP60484 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTENP60484 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTENP60484 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTENP60484 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTENP60484 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTENP60484 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTENP60484 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTENP60484 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTENP60484 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTENP60484 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTENP60484 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTENP60484 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTENP60484 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTENP60484 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTENP60484 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTENP60484 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTENP60484 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTENP60484 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTENP60484 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTENP60484 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTENP60484 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTENP60484 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTENP60484 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTENP60484 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTENP60484 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTENP60484 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTENP60484 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTENP60484 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTENP60484 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTENP60484 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTENP60484 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTENP60484 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTENP60484 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTENP60484 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTENP60484 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTENP60484 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTENP60484 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTENP60484 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTENP60484 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTENP60484 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTENP60484 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTENP60484 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTENP60484 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTENP60484 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTENP60484 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTENP60484 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTENP60484 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTENP60484 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTENP60484 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTENP60484 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTENP60484 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTENP60484 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTENP60484 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTENP60484 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTENP60484 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTENP60484 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTENP60484 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTENP60484 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTENP60484 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTENP60484 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTENP60484 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTENP60484 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTENP60484 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTENP60484 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTENP60484 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTENP60484 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTENP60484 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTENP60484 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTENP60484 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTENP60484 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTENP60484 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTENP60484 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTENP60484 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTENP60484 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTENP60484 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTENP60484 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTENP60484 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTENP60484 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTENP60484 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTENP60484 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTENP60484 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTENP60484 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTENP60484 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTENP60484 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTENP60484 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTENP60484 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTENP60484 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTENP60484 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTENP60484 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms