Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN2P57739 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms