Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS3P57727 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS3P57727 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.9 ms