Protein–RNA interactions for Protein: P56557

TMEM50B, Transmembrane protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM50BP56557 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM50BP56557 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms