Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP1P56182 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP1P56182 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP1P56182 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP1P56182 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP1P56182 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP1P56182 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP1P56182 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP1P56182 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP1P56182 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP1P56182 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP1P56182 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP1P56182 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP1P56182 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP1P56182 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP1P56182 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP1P56182 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP1P56182 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP1P56182 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP1P56182 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP1P56182 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP1P56182 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP1P56182 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP1P56182 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP1P56182 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP1P56182 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP1P56182 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP1P56182 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP1P56182 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP1P56182 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP1P56182 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP1P56182 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RRP1P56182 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP1P56182 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP1P56182 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP1P56182 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP1P56182 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP1P56182 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP1P56182 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP1P56182 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP1P56182 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP1P56182 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP1P56182 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP1P56182 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP1P56182 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP1P56182 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP1P56182 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP1P56182 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP1P56182 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP1P56182 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP1P56182 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP1P56182 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP1P56182 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP1P56182 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP1P56182 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP1P56182 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP1P56182 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP1P56182 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP1P56182 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP1P56182 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP1P56182 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP1P56182 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP1P56182 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP1P56182 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP1P56182 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP1P56182 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP1P56182 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP1P56182 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP1P56182 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP1P56182 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRP1P56182 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRP1P56182 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRP1P56182 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRP1P56182 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRP1P56182 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRP1P56182 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRP1P56182 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRP1P56182 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRP1P56182 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRP1P56182 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP1P56182 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP1P56182 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP1P56182 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP1P56182 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP1P56182 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP1P56182 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP1P56182 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP1P56182 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP1P56182 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP1P56182 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP1P56182 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP1P56182 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP1P56182 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP1P56182 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP1P56182 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP1P56182 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP1P56182 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP1P56182 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP1P56182 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRP1P56182 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms