Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SUMO3P55854 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUMO3P55854 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms