Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCL23P55773 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCL23P55773 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCL23P55773 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCL23P55773 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCL23P55773 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCL23P55773 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCL23P55773 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCL23P55773 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCL23P55773 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCL23P55773 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCL23P55773 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCL23P55773 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCL23P55773 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCL23P55773 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCL23P55773 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCL23P55773 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCL23P55773 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCL23P55773 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCL23P55773 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCL23P55773 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCL23P55773 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCL23P55773 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCL23P55773 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCL23P55773 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCL23P55773 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCL23P55773 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCL23P55773 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCL23P55773 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCL23P55773 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCL23P55773 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCL23P55773 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCL23P55773 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCL23P55773 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCL23P55773 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCL23P55773 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCL23P55773 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCL23P55773 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCL23P55773 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCL23P55773 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCL23P55773 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCL23P55773 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCL23P55773 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCL23P55773 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCL23P55773 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCL23P55773 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCL23P55773 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCL23P55773 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCL23P55773 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCL23P55773 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCL23P55773 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCL23P55773 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCL23P55773 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCL23P55773 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCL23P55773 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCL23P55773 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCL23P55773 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCL23P55773 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCL23P55773 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCL23P55773 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCL23P55773 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCL23P55773 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCL23P55773 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCL23P55773 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCL23P55773 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCL23P55773 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCL23P55773 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCL23P55773 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCL23P55773 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCL23P55773 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCL23P55773 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCL23P55773 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCL23P55773 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCL23P55773 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCL23P55773 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCL23P55773 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCL23P55773 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCL23P55773 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCL23P55773 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCL23P55773 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCL23P55773 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCL23P55773 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL23P55773 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL23P55773 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL23P55773 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL23P55773 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL23P55773 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL23P55773 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL23P55773 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL23P55773 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL23P55773 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL23P55773 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL23P55773 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL23P55773 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL23P55773 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL23P55773 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL23P55773 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL23P55773 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL23P55773 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCL23P55773 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms