Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH8P55286 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH8P55286 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH8P55286 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH8P55286 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH8P55286 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH8P55286 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH8P55286 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH8P55286 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH8P55286 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH8P55286 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH8P55286 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH8P55286 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH8P55286 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH8P55286 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH8P55286 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH8P55286 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH8P55286 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH8P55286 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH8P55286 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH8P55286 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH8P55286 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH8P55286 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH8P55286 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH8P55286 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH8P55286 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH8P55286 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH8P55286 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH8P55286 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH8P55286 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH8P55286 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH8P55286 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH8P55286 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH8P55286 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH8P55286 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH8P55286 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH8P55286 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH8P55286 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH8P55286 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH8P55286 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH8P55286 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH8P55286 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH8P55286 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH8P55286 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH8P55286 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH8P55286 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH8P55286 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH8P55286 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH8P55286 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH8P55286 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH8P55286 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH8P55286 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH8P55286 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH8P55286 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH8P55286 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH8P55286 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH8P55286 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDH8P55286 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH8P55286 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH8P55286 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH8P55286 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH8P55286 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH8P55286 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH8P55286 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH8P55286 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH8P55286 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH8P55286 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH8P55286 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH8P55286 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH8P55286 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH8P55286 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH8P55286 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH8P55286 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH8P55286 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH8P55286 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH8P55286 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH8P55286 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH8P55286 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH8P55286 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH8P55286 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH8P55286 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH8P55286 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH8P55286 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH8P55286 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH8P55286 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH8P55286 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH8P55286 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH8P55286 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH8P55286 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH8P55286 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH8P55286 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH8P55286 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH8P55286 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH8P55286 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH8P55286 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH8P55286 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH8P55286 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH8P55286 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH8P55286 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH8P55286 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms