Protein–RNA interactions for Protein: P54851

EMP2, Epithelial membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP2P54851 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMP2P54851 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMP2P54851 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP2P54851 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP2P54851 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP2P54851 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP2P54851 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP2P54851 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP2P54851 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP2P54851 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP2P54851 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP2P54851 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP2P54851 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP2P54851 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP2P54851 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EMP2P54851 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP2P54851 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP2P54851 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP2P54851 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP2P54851 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP2P54851 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP2P54851 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP2P54851 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP2P54851 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP2P54851 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP2P54851 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP2P54851 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP2P54851 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP2P54851 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP2P54851 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP2P54851 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP2P54851 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP2P54851 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP2P54851 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMP2P54851 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMP2P54851 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMP2P54851 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMP2P54851 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMP2P54851 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMP2P54851 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMP2P54851 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMP2P54851 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMP2P54851 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMP2P54851 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMP2P54851 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMP2P54851 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMP2P54851 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP2P54851 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP2P54851 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP2P54851 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP2P54851 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP2P54851 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP2P54851 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP2P54851 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP2P54851 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP2P54851 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP2P54851 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP2P54851 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP2P54851 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP2P54851 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP2P54851 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP2P54851 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP2P54851 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP2P54851 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP2P54851 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP2P54851 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP2P54851 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP2P54851 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP2P54851 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP2P54851 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMP2P54851 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMP2P54851 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMP2P54851 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMP2P54851 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMP2P54851 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP2P54851 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP2P54851 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP2P54851 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP2P54851 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP2P54851 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP2P54851 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP2P54851 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP2P54851 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP2P54851 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP2P54851 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP2P54851 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP2P54851 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP2P54851 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP2P54851 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP2P54851 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP2P54851 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP2P54851 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP2P54851 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP2P54851 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP2P54851 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP2P54851 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP2P54851 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP2P54851 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMP2P54851 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMP2P54851 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms