Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGGTBP53611 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABGGTBP53611 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABGGTBP53611 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
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