Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NDST1P52848 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDST1P52848 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDST1P52848 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDST1P52848 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDST1P52848 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDST1P52848 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDST1P52848 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDST1P52848 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDST1P52848 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDST1P52848 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDST1P52848 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDST1P52848 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NDST1P52848 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDST1P52848 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDST1P52848 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDST1P52848 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDST1P52848 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDST1P52848 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDST1P52848 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDST1P52848 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDST1P52848 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDST1P52848 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDST1P52848 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDST1P52848 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDST1P52848 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDST1P52848 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDST1P52848 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDST1P52848 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDST1P52848 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NDST1P52848 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDST1P52848 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDST1P52848 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDST1P52848 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NDST1P52848 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDST1P52848 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NDST1P52848 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDST1P52848 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDST1P52848 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDST1P52848 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDST1P52848 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDST1P52848 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDST1P52848 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDST1P52848 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDST1P52848 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDST1P52848 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDST1P52848 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDST1P52848 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDST1P52848 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDST1P52848 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDST1P52848 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDST1P52848 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDST1P52848 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDST1P52848 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDST1P52848 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDST1P52848 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDST1P52848 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDST1P52848 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDST1P52848 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDST1P52848 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDST1P52848 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDST1P52848 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDST1P52848 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NDST1P52848 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDST1P52848 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDST1P52848 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDST1P52848 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDST1P52848 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDST1P52848 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST1P52848 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST1P52848 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST1P52848 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST1P52848 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST1P52848 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDST1P52848 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDST1P52848 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDST1P52848 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDST1P52848 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDST1P52848 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST1P52848 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST1P52848 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST1P52848 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST1P52848 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST1P52848 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST1P52848 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST1P52848 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST1P52848 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST1P52848 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST1P52848 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST1P52848 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST1P52848 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST1P52848 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST1P52848 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST1P52848 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST1P52848 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST1P52848 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST1P52848 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST1P52848 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST1P52848 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST1P52848 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms