Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAP1GDS1P52306 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms