Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR4P51679 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR4P51679 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR4P51679 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR4P51679 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR4P51679 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR4P51679 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR4P51679 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR4P51679 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCR4P51679 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCR4P51679 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCR4P51679 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCR4P51679 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCR4P51679 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCR4P51679 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCR4P51679 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCR4P51679 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCR4P51679 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCR4P51679 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCR4P51679 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR4P51679 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR4P51679 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR4P51679 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR4P51679 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR4P51679 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR4P51679 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR4P51679 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR4P51679 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR4P51679 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR4P51679 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR4P51679 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR4P51679 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCR4P51679 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCR4P51679 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR4P51679 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR4P51679 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR4P51679 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR4P51679 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR4P51679 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR4P51679 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR4P51679 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR4P51679 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR4P51679 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR4P51679 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR4P51679 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR4P51679 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR4P51679 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR4P51679 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR4P51679 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR4P51679 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR4P51679 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR4P51679 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR4P51679 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR4P51679 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR4P51679 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR4P51679 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR4P51679 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR4P51679 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR4P51679 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR4P51679 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR4P51679 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR4P51679 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR4P51679 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR4P51679 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR4P51679 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR4P51679 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR4P51679 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR4P51679 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR4P51679 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR4P51679 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR4P51679 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR4P51679 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR4P51679 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR4P51679 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR4P51679 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR4P51679 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR4P51679 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR4P51679 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR4P51679 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR4P51679 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCR4P51679 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCR4P51679 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCR4P51679 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCR4P51679 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCR4P51679 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCR4P51679 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCR4P51679 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCR4P51679 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCR4P51679 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCR4P51679 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCR4P51679 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCR4P51679 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCR4P51679 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCR4P51679 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCR4P51679 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCR4P51679 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCR4P51679 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCR4P51679 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCR4P51679 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCR4P51679 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms