Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORCP51449 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORCP51449 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORCP51449 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORCP51449 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORCP51449 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORCP51449 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORCP51449 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORCP51449 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORCP51449 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORCP51449 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORCP51449 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORCP51449 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORCP51449 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORCP51449 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORCP51449 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORCP51449 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORCP51449 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORCP51449 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORCP51449 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORCP51449 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORCP51449 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORCP51449 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORCP51449 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORCP51449 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORCP51449 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORCP51449 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RORCP51449 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RORCP51449 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORCP51449 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORCP51449 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORCP51449 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORCP51449 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RORCP51449 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORCP51449 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORCP51449 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORCP51449 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORCP51449 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORCP51449 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORCP51449 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RORCP51449 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RORCP51449 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RORCP51449 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORCP51449 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RORCP51449 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORCP51449 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORCP51449 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORCP51449 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RORCP51449 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORCP51449 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORCP51449 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORCP51449 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORCP51449 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORCP51449 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RORCP51449 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORCP51449 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORCP51449 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORCP51449 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORCP51449 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORCP51449 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORCP51449 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORCP51449 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORCP51449 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORCP51449 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORCP51449 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORCP51449 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORCP51449 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORCP51449 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORCP51449 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORCP51449 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORCP51449 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORCP51449 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORCP51449 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORCP51449 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORCP51449 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORCP51449 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORCP51449 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORCP51449 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORCP51449 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORCP51449 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORCP51449 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORCP51449 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORCP51449 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORCP51449 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORCP51449 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORCP51449 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms