Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCAMP50895 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCAMP50895 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCAMP50895 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCAMP50895 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCAMP50895 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCAMP50895 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCAMP50895 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCAMP50895 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCAMP50895 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
BCAMP50895 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCAMP50895 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCAMP50895 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCAMP50895 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCAMP50895 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCAMP50895 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCAMP50895 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCAMP50895 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCAMP50895 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCAMP50895 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCAMP50895 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCAMP50895 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCAMP50895 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCAMP50895 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCAMP50895 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCAMP50895 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCAMP50895 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCAMP50895 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCAMP50895 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCAMP50895 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCAMP50895 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCAMP50895 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCAMP50895 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCAMP50895 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
BCAMP50895 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCAMP50895 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCAMP50895 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCAMP50895 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCAMP50895 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCAMP50895 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
BCAMP50895 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCAMP50895 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCAMP50895 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCAMP50895 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCAMP50895 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCAMP50895 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCAMP50895 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCAMP50895 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
BCAMP50895 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCAMP50895 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCAMP50895 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
BCAMP50895 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCAMP50895 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCAMP50895 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCAMP50895 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCAMP50895 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCAMP50895 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCAMP50895 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BCAMP50895 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCAMP50895 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCAMP50895 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BCAMP50895 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCAMP50895 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCAMP50895 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCAMP50895 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCAMP50895 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCAMP50895 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCAMP50895 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCAMP50895 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCAMP50895 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCAMP50895 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCAMP50895 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCAMP50895 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BCAMP50895 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCAMP50895 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCAMP50895 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCAMP50895 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BCAMP50895 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCAMP50895 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCAMP50895 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BCAMP50895 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCAMP50895 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCAMP50895 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCAMP50895 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCAMP50895 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCAMP50895 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCAMP50895 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCAMP50895 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCAMP50895 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BCAMP50895 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCAMP50895 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCAMP50895 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCAMP50895 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCAMP50895 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCAMP50895 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCAMP50895 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BCAMP50895 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCAMP50895 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCAMP50895 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCAMP50895 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms