Protein–RNA interactions for Protein: P50552

VASP, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASPP50552 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VASPP50552 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VASPP50552 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VASPP50552 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VASPP50552 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VASPP50552 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VASPP50552 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VASPP50552 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VASPP50552 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VASPP50552 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VASPP50552 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VASPP50552 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VASPP50552 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VASPP50552 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VASPP50552 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VASPP50552 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VASPP50552 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VASPP50552 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VASPP50552 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VASPP50552 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VASPP50552 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VASPP50552 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VASPP50552 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VASPP50552 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VASPP50552 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VASPP50552 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VASPP50552 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VASPP50552 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VASPP50552 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VASPP50552 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VASPP50552 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VASPP50552 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VASPP50552 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VASPP50552 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VASPP50552 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VASPP50552 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VASPP50552 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VASPP50552 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VASPP50552 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VASPP50552 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VASPP50552 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VASPP50552 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VASPP50552 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VASPP50552 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VASPP50552 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VASPP50552 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VASPP50552 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VASPP50552 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VASPP50552 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VASPP50552 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VASPP50552 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VASPP50552 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VASPP50552 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VASPP50552 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VASPP50552 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VASPP50552 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VASPP50552 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VASPP50552 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VASPP50552 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VASPP50552 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VASPP50552 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VASPP50552 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VASPP50552 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VASPP50552 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VASPP50552 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VASPP50552 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VASPP50552 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VASPP50552 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VASPP50552 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VASPP50552 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VASPP50552 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VASPP50552 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VASPP50552 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VASPP50552 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VASPP50552 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VASPP50552 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VASPP50552 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VASPP50552 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VASPP50552 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VASPP50552 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VASPP50552 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VASPP50552 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VASPP50552 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VASPP50552 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VASPP50552 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VASPP50552 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VASPP50552 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VASPP50552 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VASPP50552 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VASPP50552 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VASPP50552 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VASPP50552 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VASPP50552 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VASPP50552 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VASPP50552 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VASPP50552 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VASPP50552 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VASPP50552 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VASPP50552 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VASPP50552 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms