Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSEN1P49768 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSEN1P49768 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms