Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUMBP49757 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUMBP49757 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUMBP49757 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUMBP49757 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUMBP49757 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUMBP49757 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUMBP49757 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUMBP49757 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUMBP49757 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUMBP49757 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUMBP49757 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUMBP49757 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUMBP49757 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUMBP49757 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUMBP49757 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUMBP49757 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUMBP49757 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUMBP49757 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUMBP49757 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUMBP49757 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUMBP49757 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUMBP49757 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUMBP49757 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUMBP49757 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUMBP49757 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUMBP49757 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUMBP49757 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUMBP49757 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUMBP49757 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUMBP49757 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUMBP49757 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUMBP49757 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUMBP49757 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUMBP49757 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUMBP49757 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUMBP49757 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NUMBP49757 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUMBP49757 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUMBP49757 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUMBP49757 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUMBP49757 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUMBP49757 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUMBP49757 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUMBP49757 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUMBP49757 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUMBP49757 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUMBP49757 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUMBP49757 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUMBP49757 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUMBP49757 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUMBP49757 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUMBP49757 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NUMBP49757 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUMBP49757 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NUMBP49757 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUMBP49757 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUMBP49757 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUMBP49757 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUMBP49757 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUMBP49757 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUMBP49757 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUMBP49757 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUMBP49757 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUMBP49757 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUMBP49757 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUMBP49757 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUMBP49757 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUMBP49757 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUMBP49757 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUMBP49757 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUMBP49757 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUMBP49757 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUMBP49757 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUMBP49757 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUMBP49757 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUMBP49757 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUMBP49757 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUMBP49757 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUMBP49757 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUMBP49757 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUMBP49757 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUMBP49757 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUMBP49757 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUMBP49757 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUMBP49757 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUMBP49757 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUMBP49757 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUMBP49757 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUMBP49757 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUMBP49757 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUMBP49757 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUMBP49757 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUMBP49757 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUMBP49757 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUMBP49757 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUMBP49757 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUMBP49757 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUMBP49757 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUMBP49757 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms