Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTBP49356 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTBP49356 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTBP49356 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTBP49356 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTBP49356 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTBP49356 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNTBP49356 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNTBP49356 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FNTBP49356 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNTBP49356 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNTBP49356 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTBP49356 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNTBP49356 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNTBP49356 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNTBP49356 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNTBP49356 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNTBP49356 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNTBP49356 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNTBP49356 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNTBP49356 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNTBP49356 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNTBP49356 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTBP49356 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTBP49356 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTBP49356 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTBP49356 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTBP49356 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTBP49356 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNTBP49356 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNTBP49356 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTBP49356 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTBP49356 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTBP49356 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTBP49356 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTBP49356 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTBP49356 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTBP49356 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTBP49356 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTBP49356 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTBP49356 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTBP49356 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTBP49356 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTBP49356 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTBP49356 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTBP49356 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTBP49356 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTBP49356 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTBP49356 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTBP49356 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTBP49356 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTBP49356 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTBP49356 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTBP49356 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTBP49356 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNTBP49356 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNTBP49356 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNTBP49356 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNTBP49356 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNTBP49356 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTBP49356 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTBP49356 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTBP49356 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTBP49356 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTBP49356 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTBP49356 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNTBP49356 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNTBP49356 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNTBP49356 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNTBP49356 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNTBP49356 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNTBP49356 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNTBP49356 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNTBP49356 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNTBP49356 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FNTBP49356 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNTBP49356 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNTBP49356 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTBP49356 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTBP49356 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTBP49356 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTBP49356 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTBP49356 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTBP49356 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTBP49356 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTBP49356 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTBP49356 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms