Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMAN1P49257 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMAN1P49257 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms