Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A6P48664 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms