Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC6A11P48066 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A11P48066 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms