Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL21P46778 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL21P46778 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL21P46778 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL21P46778 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL21P46778 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL21P46778 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL21P46778 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL21P46778 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL21P46778 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL21P46778 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL21P46778 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL21P46778 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL21P46778 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL21P46778 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL21P46778 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL21P46778 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL21P46778 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL21P46778 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL21P46778 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL21P46778 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL21P46778 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL21P46778 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL21P46778 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL21P46778 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL21P46778 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL21P46778 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL21P46778 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL21P46778 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL21P46778 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL21P46778 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL21P46778 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL21P46778 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL21P46778 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL21P46778 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL21P46778 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL21P46778 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL21P46778 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL21P46778 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL21P46778 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL21P46778 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL21P46778 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL21P46778 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL21P46778 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL21P46778 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL21P46778 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL21P46778 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL21P46778 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL21P46778 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL21P46778 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL21P46778 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL21P46778 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL21P46778 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL21P46778 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL21P46778 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL21P46778 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL21P46778 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL21P46778 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL21P46778 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL21P46778 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL21P46778 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL21P46778 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL21P46778 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL21P46778 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPL21P46778 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL21P46778 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL21P46778 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL21P46778 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL21P46778 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL21P46778 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL21P46778 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL21P46778 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL21P46778 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL21P46778 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL21P46778 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL21P46778 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL21P46778 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL21P46778 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL21P46778 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL21P46778 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL21P46778 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL21P46778 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL21P46778 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL21P46778 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL21P46778 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL21P46778 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL21P46778 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms