Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRXP46100 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRXP46100 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRXP46100 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRXP46100 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRXP46100 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRXP46100 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRXP46100 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRXP46100 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRXP46100 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRXP46100 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRXP46100 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRXP46100 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRXP46100 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRXP46100 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRXP46100 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRXP46100 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRXP46100 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRXP46100 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRXP46100 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRXP46100 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRXP46100 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRXP46100 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRXP46100 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRXP46100 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRXP46100 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRXP46100 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRXP46100 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRXP46100 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRXP46100 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRXP46100 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRXP46100 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRXP46100 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRXP46100 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRXP46100 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRXP46100 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRXP46100 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRXP46100 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRXP46100 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRXP46100 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRXP46100 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRXP46100 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRXP46100 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRXP46100 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRXP46100 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRXP46100 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRXP46100 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRXP46100 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRXP46100 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRXP46100 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRXP46100 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRXP46100 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRXP46100 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRXP46100 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRXP46100 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRXP46100 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRXP46100 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRXP46100 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRXP46100 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRXP46100 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRXP46100 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRXP46100 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRXP46100 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRXP46100 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRXP46100 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRXP46100 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRXP46100 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRXP46100 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRXP46100 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRXP46100 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRXP46100 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRXP46100 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRXP46100 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRXP46100 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRXP46100 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRXP46100 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRXP46100 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRXP46100 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRXP46100 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRXP46100 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRXP46100 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRXP46100 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRXP46100 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRXP46100 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRXP46100 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRXP46100 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRXP46100 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRXP46100 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRXP46100 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRXP46100 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRXP46100 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRXP46100 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRXP46100 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRXP46100 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRXP46100 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRXP46100 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRXP46100 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRXP46100 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRXP46100 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRXP46100 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms