Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP5P45974 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP5P45974 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP5P45974 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP5P45974 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP5P45974 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP5P45974 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP5P45974 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP5P45974 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP5P45974 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP5P45974 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP5P45974 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP5P45974 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP5P45974 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP5P45974 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP5P45974 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP5P45974 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP5P45974 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP5P45974 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP5P45974 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP5P45974 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP5P45974 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP5P45974 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP5P45974 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP5P45974 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP5P45974 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP5P45974 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP5P45974 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP5P45974 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP5P45974 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP5P45974 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
USP5P45974 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP5P45974 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP5P45974 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP5P45974 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP5P45974 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP5P45974 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP5P45974 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP5P45974 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP5P45974 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP5P45974 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP5P45974 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP5P45974 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP5P45974 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP5P45974 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP5P45974 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP5P45974 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP5P45974 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP5P45974 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP5P45974 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP5P45974 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP5P45974 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP5P45974 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP5P45974 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP5P45974 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP5P45974 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP5P45974 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP5P45974 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP5P45974 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP5P45974 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP5P45974 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP5P45974 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP5P45974 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP5P45974 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP5P45974 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP5P45974 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP5P45974 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP5P45974 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP5P45974 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP5P45974 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP5P45974 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP5P45974 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP5P45974 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP5P45974 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP5P45974 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP5P45974 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP5P45974 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP5P45974 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP5P45974 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP5P45974 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP5P45974 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP5P45974 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP5P45974 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP5P45974 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP5P45974 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP5P45974 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP5P45974 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP5P45974 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP5P45974 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP5P45974 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP5P45974 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP5P45974 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP5P45974 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP5P45974 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP5P45974 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP5P45974 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP5P45974 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP5P45974 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP5P45974 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP5P45974 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms