Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACADSBP45954 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACADSBP45954 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACADSBP45954 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACADSBP45954 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACADSBP45954 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADSBP45954 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACADSBP45954 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms