Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRATP43155 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRATP43155 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRATP43155 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRATP43155 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRATP43155 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRATP43155 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRATP43155 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRATP43155 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRATP43155 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRATP43155 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRATP43155 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRATP43155 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRATP43155 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRATP43155 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRATP43155 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRATP43155 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRATP43155 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRATP43155 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRATP43155 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRATP43155 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRATP43155 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRATP43155 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRATP43155 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRATP43155 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRATP43155 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRATP43155 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRATP43155 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRATP43155 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRATP43155 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRATP43155 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRATP43155 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRATP43155 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRATP43155 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRATP43155 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRATP43155 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRATP43155 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRATP43155 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRATP43155 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRATP43155 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRATP43155 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRATP43155 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRATP43155 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRATP43155 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRATP43155 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRATP43155 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRATP43155 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRATP43155 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRATP43155 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRATP43155 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRATP43155 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRATP43155 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRATP43155 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRATP43155 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRATP43155 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRATP43155 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRATP43155 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRATP43155 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRATP43155 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRATP43155 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRATP43155 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRATP43155 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRATP43155 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRATP43155 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRATP43155 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRATP43155 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRATP43155 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRATP43155 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRATP43155 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRATP43155 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRATP43155 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRATP43155 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRATP43155 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRATP43155 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRATP43155 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRATP43155 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRATP43155 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRATP43155 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRATP43155 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRATP43155 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRATP43155 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRATP43155 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRATP43155 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms