Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTGFRP43088 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTGFRP43088 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms