Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC1A4P43007 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC1A4P43007 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms