Protein–RNA interactions for Protein: P42773

CDKN2C, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2CP42773 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2CP42773 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2CP42773 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2CP42773 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2CP42773 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms