Protein–RNA interactions for Protein: P41279

MAP3K8, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K8P41279 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAP3K8P41279 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K8P41279 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP3K8P41279 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP3K8P41279 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP3K8P41279 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP3K8P41279 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms