Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDH1P40925 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDH1P40925 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDH1P40925 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDH1P40925 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDH1P40925 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDH1P40925 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDH1P40925 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MDH1P40925 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDH1P40925 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDH1P40925 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDH1P40925 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDH1P40925 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDH1P40925 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDH1P40925 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDH1P40925 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDH1P40925 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDH1P40925 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDH1P40925 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDH1P40925 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MDH1P40925 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MDH1P40925 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDH1P40925 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MDH1P40925 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDH1P40925 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MDH1P40925 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MDH1P40925 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDH1P40925 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDH1P40925 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDH1P40925 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDH1P40925 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDH1P40925 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDH1P40925 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDH1P40925 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDH1P40925 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDH1P40925 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MDH1P40925 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDH1P40925 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MDH1P40925 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDH1P40925 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDH1P40925 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDH1P40925 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDH1P40925 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDH1P40925 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDH1P40925 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDH1P40925 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDH1P40925 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDH1P40925 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDH1P40925 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDH1P40925 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDH1P40925 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDH1P40925 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MDH1P40925 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDH1P40925 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDH1P40925 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDH1P40925 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDH1P40925 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDH1P40925 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDH1P40925 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MDH1P40925 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDH1P40925 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDH1P40925 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDH1P40925 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MDH1P40925 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MDH1P40925 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDH1P40925 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDH1P40925 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDH1P40925 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDH1P40925 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDH1P40925 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDH1P40925 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDH1P40925 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MDH1P40925 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDH1P40925 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDH1P40925 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDH1P40925 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDH1P40925 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDH1P40925 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDH1P40925 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDH1P40925 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDH1P40925 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDH1P40925 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDH1P40925 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDH1P40925 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDH1P40925 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDH1P40925 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDH1P40925 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MDH1P40925 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDH1P40925 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDH1P40925 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDH1P40925 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDH1P40925 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDH1P40925 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDH1P40925 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDH1P40925 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDH1P40925 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDH1P40925 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDH1P40925 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDH1P40925 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDH1P40925 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms