Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP8P40818 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP8P40818 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP8P40818 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP8P40818 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP8P40818 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP8P40818 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP8P40818 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP8P40818 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP8P40818 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP8P40818 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP8P40818 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP8P40818 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP8P40818 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP8P40818 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP8P40818 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP8P40818 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP8P40818 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP8P40818 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP8P40818 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP8P40818 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP8P40818 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP8P40818 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP8P40818 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP8P40818 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP8P40818 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP8P40818 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP8P40818 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP8P40818 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP8P40818 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP8P40818 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP8P40818 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP8P40818 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP8P40818 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP8P40818 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP8P40818 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP8P40818 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP8P40818 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP8P40818 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP8P40818 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP8P40818 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP8P40818 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP8P40818 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP8P40818 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP8P40818 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP8P40818 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP8P40818 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP8P40818 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP8P40818 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP8P40818 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP8P40818 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP8P40818 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP8P40818 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP8P40818 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP8P40818 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP8P40818 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP8P40818 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP8P40818 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP8P40818 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP8P40818 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP8P40818 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP8P40818 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP8P40818 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP8P40818 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP8P40818 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP8P40818 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP8P40818 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP8P40818 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP8P40818 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP8P40818 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP8P40818 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP8P40818 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP8P40818 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP8P40818 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP8P40818 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP8P40818 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP8P40818 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP8P40818 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP8P40818 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP8P40818 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP8P40818 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP8P40818 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP8P40818 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP8P40818 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP8P40818 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP8P40818 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP8P40818 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP8P40818 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP8P40818 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP8P40818 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP8P40818 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP8P40818 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP8P40818 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP8P40818 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP8P40818 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP8P40818 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP8P40818 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP8P40818 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP8P40818 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP8P40818 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms