Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL13AP40429 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL13AP40429 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL13AP40429 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL13AP40429 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL13AP40429 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL13AP40429 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL13AP40429 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL13AP40429 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL13AP40429 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL13AP40429 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL13AP40429 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL13AP40429 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL13AP40429 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL13AP40429 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms