Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBRP36941 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBRP36941 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBRP36941 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBRP36941 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBRP36941 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBRP36941 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBRP36941 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBRP36941 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBRP36941 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBRP36941 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBRP36941 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBRP36941 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBRP36941 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBRP36941 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBRP36941 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBRP36941 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBRP36941 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBRP36941 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBRP36941 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBRP36941 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBRP36941 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBRP36941 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBRP36941 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBRP36941 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBRP36941 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBRP36941 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBRP36941 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBRP36941 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBRP36941 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBRP36941 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBRP36941 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBRP36941 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBRP36941 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBRP36941 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBRP36941 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBRP36941 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTBRP36941 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBRP36941 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBRP36941 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBRP36941 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBRP36941 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBRP36941 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBRP36941 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBRP36941 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBRP36941 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBRP36941 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBRP36941 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBRP36941 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBRP36941 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBRP36941 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBRP36941 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBRP36941 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBRP36941 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBRP36941 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBRP36941 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBRP36941 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBRP36941 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBRP36941 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBRP36941 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBRP36941 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBRP36941 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBRP36941 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBRP36941 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBRP36941 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBRP36941 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBRP36941 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBRP36941 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBRP36941 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBRP36941 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTBRP36941 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTBRP36941 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LTBRP36941 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTBRP36941 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBRP36941 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBRP36941 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBRP36941 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBRP36941 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBRP36941 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBRP36941 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBRP36941 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBRP36941 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBRP36941 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBRP36941 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBRP36941 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBRP36941 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBRP36941 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBRP36941 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBRP36941 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBRP36941 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBRP36941 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBRP36941 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBRP36941 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBRP36941 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBRP36941 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBRP36941 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBRP36941 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBRP36941 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBRP36941 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBRP36941 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms