Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HNF1BP35680 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HNF1BP35680 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HNF1BP35680 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HNF1BP35680 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HNF1BP35680 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HNF1BP35680 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HNF1BP35680 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HNF1BP35680 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HNF1BP35680 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms